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    发布时间: 2018 - 12 - 13
    发表期刊:Postharvest Biology and Technology影响因子:IF=3.112(SCI二区)研究背景草莓(Fragaria×ananassa Duch.)由于其独特的风味和多汁的质地,是一种在世界范围内广受欢迎的园艺作物。它是维生素C和抗氧化剂的良好来源,但由于软化快、机械损坏、真菌腐烂和采后代谢迅速,很容易腐烂。在6℃贮藏1d后,草莓果实中的蔗糖水平由于快速的采后代谢而达到无法检测的水平。虽然草莓品种的贮藏期不同,但平均贮藏期通常只有3-5d。先前研究报道了CO2诱导的生理和机械变化,收获后,草莓果实中含有较高水平的二氧化碳(CO2)以提高可储存性。暴露于20%CO2中12或48h的草莓果实比在环境空气中贮藏3d的水果更结实。高浓度的二氧化碳会影响细胞壁钙的结合,提高果实的硬度。为了深入了解高浓度CO2在分子和生化水平上的影响,多学科方法是必要的。整合基因组学、蛋白质组学和代谢组学将有助于更好地理解植物对外界刺激的全面定性和定量反应。尽管对草莓果实采后对高CO2的响应进行了研究,但对细胞反应的全面了解仍不甚清楚。本研究联合转录组学和代谢组学方法来研究分子和细胞反应,将收获的草莓果实短期暴露于30%CO2,以全面了解改善的果实耐贮性。材料与方法01植物材料与CO2处理草莓于80%红色收获,收获后,果实立即运往实验室。选择大小和颜色一致的果实作为试验材料。分组:0D:环境空气0h(收获后立即)1D:3h环境空气处理后1d1DT:3h 30%CO2处理后1d 02硬度测定随机抽取3个重复容器中的10个草莓果实进行硬度测定(n=30),经硬度测定后丢弃。采用CT-3纹理分析仪进行硬度测量。用直径为100mm、速度为2mm、应变为5mm、直径为100 mm的平板探针,在果实赤道面测量果实硬度(N)。草莓果实表面微生物...
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    发布时间: 2018 - 12 - 13
    集思慧远客户发表——《王枣子根、茎和叶的比较转录组分析揭示了王枣子素生物合成的候选基因》英文标题:Comparative transcriptome analysis of roots, stems and leaves Isodon amethystoides reveals candidate genes involved in Wangzaozins biosynthesis杂志:BMC PLANT BIOLOGY影响因子:IF=3.930摘要    王枣子是一种重要的中药植物,具有治疗多种疾病的药理作用,包括肺结核。四环二萜类化合物王枣子素(王枣子甲素Wang zaozin A,王枣子乙素GlucocalyxB)是王枣子的主要生物活性化合物。然而,关于这些化合物生物合成的分子信息仍然不清楚。通过对王枣子中王枣子素积累水平的研究,发现该植物的根、茎和叶组织有很大的变化,表明不同组织间代谢产物生物合成和积累的可能存在差异。为了更好地阐明四环二萜生物合成途径,我们对根、茎和叶组织进行转录组测序,并进行了de novo序列组装和分析。分析了与二萜类生物合成有关的候选基因,如CPS、KSL等。用qRT-PCR方法对8种涉及四环二萜类生物合成的转录本在王枣子不同组织中的表达谱进行了验证,解构该通路的基因表达谱。ISPD、ISPF和ISPH(MEP途径)以及IaCPS和IaKSL(二萜类途径)候选基因在叶片和根中的差异表达,可能是造成王枣子叶片中王枣子素积累较高的原因之一。本文报道的基因组数据和分析为进一步研究这一重要药用植物奠定了基础。材料与方法植物材料:一年生健康王枣子个体的根、茎、叶(3个重复)王枣子素的提取与鉴定(靶标代谢):种类:王枣子甲素、王枣子乙素和王枣子丙素        &...
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    发布时间: 2018 - 12 - 10
    英文标题:Selection and Validation of Novel RT-qPCR Reference Genes under Hormonal Stimuli and in Diferent Tissues of Santalum album杂志:Scientific  Reports影响因子:IF=4.122摘要   逆转录实时定量聚合酶链式反应 (RT-qPCR)因其高通量、特异性和敏感性而被广泛应用于基因表达水平的研究。为了获得准确可靠的结果,RT-qPCR分析必须有一个合适的参考基因。到目前为止,经济热带树种檀香((Santalum album L.)还没有被验证的可靠参考基因。在本研究中,有13个候选参考基因(包括从大量的檀香转录组数据中筛选出的12个新的可能的参考基因,以及目前使用的β-actin基因)在不同的组织(茎、叶、根和愈伤组织)、以及水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯 (MeJA)、赤霉素(GA)处理作用下的愈伤组织中,用GeNorm,NormFinder,BestKeeper,Delta CT和 RefFinder算法综合验证。几种新的候选参考基因比目前使用的传统基因ACT要稳定得多。SA处理中ODD和Fbp1、MeJA处理中的CSA 和Fbp3、JA处理中的PP2C和Fbp2、以及3个激素处理中FBP 1和FBP 2,分别是最准确的参考基因。当FAB1A与PP2C结合后,被鉴定为四种组织最适宜的参考基因组合。而HLMt, PPR和FAB1A的组合则是所有实验样本中最理想的参考基因。此外,为了验证我们的结果,我们还通过参考基因及他们的组合在MeJA处理下的三种檀香组织中评估了SaSSy基因的相对表达水平。本研究中所鉴定的参考基因将提高RT-qPCR分析的准确性,并将有...
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    发布时间: 2018 - 12 - 03
    发表期刊:Microbiome影响因子:9.133(SCI一区)研究背景最近几年,对肠道微生物群(GM)的研究已经不仅仅是描述分类组成,通常是将16S rRNA基因测序应用于粪便样本,更广泛地研究GM的功能潜力,这是通过鸟枪法宏基因组学(MG)方法实现的。群体MG研究表明,尽管存在较大的个体间结构/组成变异,GMs仍有一组稳定的核心功能。然而,由于测序的基因不一定表达,MG不能提供可靠的信息,说明哪些微生物的功能特征实际上在响应宿主代谢、免疫、神经生物学、饮食或其他环境因素的刺激而发生变化。相反,这类信息可以由功能宏组学收集,如宏转录组学(MT)和宏蛋白质组学(MP),它们对微扰具有较高的敏感性,因此可能更好地反映宿主微生物相互作用。在这方面,特别令人感兴趣的是调查人类群体中潜在的和实际活跃的GM特征之间的关系,为了从已知的MG的潜能开始鉴定在健康肠中组成型表达的微生物功能。最近的一项研究已经针对MT实现了这一目标,在具有最高表达率(mRNA/DNA比率)和参与淀粉代谢,氨基酸生物合成,孢子形成和以及具有最低表达率的肽聚糖生物合成的基因中发现了核糖体蛋白和柠檬酸循环酶的转录物。人们对微生物蛋白的了解较少,尽管它们提供了有关GM代谢的主要信息,并且代表了宿主-GM相互作用中的关键分子。尽管有一些开创性的研究提出了对疾病有关的人类群体中的宏基因组和宏蛋白组的分析,到目前为止,还没有系统地、比较地调查健康人群的分类学和功能特征,这种特征可能和实际由GM表达。材料与方法01实验设计图1本研究的实验设计注:从临床监测的撒丁岛人群中选出15名健康成人(男性7名,女性8名)。从每个人身上采集粪便样本,同时进行Illumina鸟枪法DNA测序(宏基因组)和LTQ-Orbitrap鸟枪法质谱分析(宏蛋白组)。宏基因组学也被用作序列数据库,以便进行严格的宏蛋白质组/宏基因组比较,并进行分类和功...
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    发布时间: 2018 - 11 - 26
    摘要全转录组范围内鉴定能与蛋白结合的RNA(RBPs),是了解转录后基因调控网络的必要条件。然而RBPs蛋白组的研究主要局限于多聚腺苷酸的RNA与蛋白的结合,对于没有ploy-A尾的RNA(主要的是非编码RNA和RNA前体)几乎都没发现。本文介绍了一种点击化学(主旨是通过小单元的拼接,来快速可靠地完成形形色色分子的化学合成。它尤其强调开辟以碳-杂原子键(C-X-C)合成为基础的组合化学新方法,并借助这些反应(点击反应)来简单高效地获得分子多样性。)辅助的RNA互作捕获策略(CARIC),能够对RBPs进行无差别鉴定,不受RNA是否具有ploy-A尾的约束。CARIC主要是利用炔基尿苷类似物对RNA进行标记,并在活体内进行RNA-protein光照交联,然后与叠氮化物生物素进行点击化学反应,亲和富集后进行蛋白组分析。利用CARIC在人的宫颈癌细胞中鉴定到597个RBPs,包括130个之前未知的RBPs。这些新发现的RBPs可能是和非编码RNA结合的,因此发现了一些之前未知的非编码RNA参与的过程(例如蛋白酶体功能和中间代谢)。材料方法实验材料:人的宫颈癌细胞,胚肾细胞;质粒构建和细胞转染:克隆宫颈癌细胞cDNA(hnRNPC,MBNL1,VDAC1,NME2),克隆质粒:VigoFect;几种已知RPBs用来验证CARIC技术成功率CARIC分离出的RNA测序:Illumina HisEq 4000 PE150;蛋白质谱检测:LC-MS/MS,Easy nLC 1000 system +Velos Pro Orbitrap Elite mass spectrometer;质谱数据分析:MaxQuant version 1.5.5.1(原始数据分析),依靠人的蛋白数据(UniProt)Andromeda search engine进行蛋白查询;CARIC RBPs验证:CLIP...
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    发布时间: 2018 - 11 - 09
    前沿慢性阻塞性肺病(COPD)是一种炎性疾病,其特征在于进行性空气流量限制,并且被认为部分地由于响应于慢性空气污染物暴露(主要来自吸烟)而引起的夸大的肺部炎症。目前可用的治疗方法在很大程度上是无效的。因此,有效治疗COPD迫切需要新型的治疗药物。前期系统药理学鉴定了补肺益肾方(BYF)的195种潜在靶点,并被证实对慢性阻塞性肺疾病(COPD)大鼠有短期治疗作用。然而,对慢性阻塞性肺疾病(COPD)的长期疗效及机制尚不清楚。因此,本研究以慢性阻塞性肺疾病(COPD)大鼠为研究对象,于第9~20周给药。然后通过转录组学-蛋白质组学-代谢组学分析第32周BYF对慢性阻塞性肺病大鼠的长期影响。材料与方法样本收集第0-8周构建COPD大鼠模型,将32只大鼠置于一个暴露于烟草和反复肺炎克雷伯菌感染的封闭的盒子里,第9-20周大鼠每日灌胃给予生理盐水(2mL)、BYF(4.44g/kg,0.5g/ml)和氨茶碱(2.3mg/kg)。检测方法转录组:Microarray(4×44K)大鼠全基因组表达谱芯片;蛋白组:8-plex iTRAQ,NanoLC-QTOF-MS;代谢组:Agilent-1200 LC-Agilent-6520 Q-TOF;数据分析Agilent GeneSpring GX software version 11.0Mascot:蛋白质鉴定Mass Hunter:代谢物鉴定SIMCA-P:PLS-DA基因、蛋白质和代谢物集富集、网络和通路分析Bingo(CytosCapev3.1.1插件)用于分析转录本和蛋白质的分子功能;DAVID和KEGG数据库对转录本和蛋白质进行途径富集分析。Metscape用于分析基因、蛋白质和代谢组学数据的整合途径;ClueGO(Cytoscape插件被用来探索基因和蛋白的分子功能。MetaboAnalyst 3.0被用来确定代谢物...
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综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

日期: 2018-12-13
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综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

发表期刊:Postharvest Biology and Technology

影响因子:IF=3.112(SCI二区)


综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
研究背景
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

草莓(Fragaria×ananassa Duch.)由于其独特的风味和多汁的质地,是一种在世界范围内广受欢迎的园艺作物。它是维生素C和抗氧化剂的良好来源,但由于软化快、机械损坏、真菌腐烂和采后代谢迅速,很容易腐烂。在6℃贮藏1d后,草莓果实中的蔗糖水平由于快速的采后代谢而达到无法检测的水平。虽然草莓品种的贮藏期不同,但平均贮藏期通常只有3-5d。先前研究报道了CO2诱导的生理和机械变化,收获后,草莓果实中含有较高水平的二氧化碳(CO2)以提高可储存性。暴露于20%CO2中12或48h的草莓果实比在环境空气中贮藏3d的水果更结实。高浓度的二氧化碳会影响细胞壁钙的结合,提高果实的硬度。

为了深入了解高浓度CO2在分子和生化水平上的影响,多学科方法是必要的。整合基因组学、蛋白质组学和代谢组学将有助于更好地理解植物对外界刺激的全面定性和定量反应。尽管对草莓果实采后对高CO2的响应进行了研究,但对细胞反应的全面了解仍不甚清楚。本研究联合转录组学和代谢组学方法来研究分子和细胞反应,将收获的草莓果实短期暴露于30%CO2,以全面了解改善的果实耐贮性。

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应


综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
材料与方法
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
01

植物材料与CO2处理

草莓于80%红色收获,收获后,果实立即运往实验室。选择大小和颜色一致的果实作为试验材料。

分组:

0D:环境空气0h(收获后立即)

1D:3h环境空气处理后1d

1DT:3h 30%CO2处理后1d 

02

硬度测定

随机抽取3个重复容器中的10个草莓果实进行硬度测定(n=30),经硬度测定后丢弃。采用CT-3纹理分析仪进行硬度测量。用直径为100mm、速度为2mm、应变为5mm、直径为100 mm的平板探针,在果实赤道面测量果实硬度(N)。


草莓果实表面微生物测定

随机抽取3个重复容器中的1个草莓果实进行微生物分析(n=3)。用3M膜好氧计数板或3M膜酵母和霉菌计数板(3M)培养果实表面微生物,评价CO2的杀菌效果。


不溶性果胶测定

采用细胞壁提取液进行不溶性果胶(insoluble pectin)测定。随机抽取3个重复容器中的1个果实进行检测(n=3)。用Multiple Plate Reader(Perkin Elmer,Waltham,MA,USA)在525nm处测定吸光度。


透射电镜

分别于3d和5d采摘新鲜草莓果实,将果实肩部切成1mm长的三角形,组织切成1-2mm厚的切片,进行透射电镜(TEM)观察。

03
转录组学

检测平台:HiSeq 2500 PE250bp

生物信息学分析:CLC Genomics Workbench ver. 3.7.1;Trinity ver. 2.0.2;Velvet ver. 1.1.04;Oases ver. 0.1.21用于基因组装;Blast2GO ver. 2.6.5用于GO注释;KEGG以及Mapman 3.6.0用于差异基因功能注释。


代谢组学

检测平台:GC-MS ISQ LT system

生物信息学分析:MetaboAnalyst 3.0用于树状图构建、热图聚类分析、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)以及及代谢途径分析。



综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
主要研究结果
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

01

短期暴露于30%CO2可以减少水果腐烂

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

1.草莓果实在25°C30%CO2短期(3h)暴露对10°C贮藏期间果实品质的影响

注:(a)贮藏后10d暴露于周围空气(对照,左)和30%CO2(处理,右)下的水果外观;(b)水果腐烂;(C)果实硬度。在贮藏后0h(采收后立即)、3h(贮藏3h后)、6h、12h、1d、3d、5d、7d和10d分别测定果实硬度。对于果实腐烂,数据是三个重复的均值±标准差。就果实硬度而言,数据是30个草莓果实的平均值±标准差(n=30)。

30%CO2处理的草莓果实的灰霉病比周围空气处理的少(图1a)。对照果实在贮藏5d后开始腐烂,CO2处理减少了果实贮藏期间的腐烂。处理后10d,27%的对照果实腐烂,而CO2处理的果实只有19%腐烂(图1b)。为了评价CO2的抗菌效果,我们测定了对照表面的微生物数量,并对处理后3h后的果实样品进行了处理,两组结果无显著性差异。这证实了CO2处理的果实的减少的腐烂和可储存性的改善不是由于消毒效果,而是由果实中CO2处理诱导的细胞反应或CO2对胶束生长和孢子萌发的直接抑制作用。

CO2处理还表现出果实在10℃贮藏期间软化的延迟(图1c),收获期果实硬度为10.25N,随着贮藏时间的延长,空气处理对照果实硬度为7.9N,CO2处理草莓果实硬度为9.16N。贮藏1d至10d,CO2处理与对照果实硬度差异显著,3、5d果实硬度最高。

02

DEGs在细胞壁和次生代谢相关的途径中富集

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

2 DEG数和DEG相关性

注:(a)0D vs 1D,0D vs 1DT和1D vs 1DT样品的上调DEG的维恩图。(b)下调的DEGs的维恩图。(c)在0D与1D和0D与1DT之间共同上调的958个DEGs的Pearson相关系数。(d)在0D与1D和0D与1DT之间共同下调的1407个DEGs的Pearson相关系数。(e)在1D与1DT中RNA测序和qRT-PCR数据之间表达水平的Pearson相关系数。

本研究对0D,1D和1DT草莓果实的转录组进行了进一步分析,以阐述草莓果实短期暴露于30%的CO2受到的细胞反应。GO分析结果显示,大多数(96%)被注释。0D vs 1D检测到3750个contigs差异表达(1643个上调,2107个下调)(图2a,b);1Dvs 1DT检测到958个上调基因和1407个下调基因。这些DEGs占0D与1DT的DEG的50%和0D与1D的DEG的63%(图2a,b),表达模式与较高的Pearson相关系数一致(图2c,d)。从1D和1DT之间的比较中特异性检测到的325个上调基因和216个下调基因用于研究30%CO2的影响。

1D vs 1DT的DEGs的富集KEGG路径不同于0D vs 1DT的DEGs的KEGG路径,显示了30%CO2处理的效果,根据Fisher的精确测试,其中“嘧啶代谢”和“甘氨酰鞘脂生物合成”分别在上调的DEGs和在下调的DEGs中显著富集,具有最高的意义。大多数与“嘧啶代谢”和“单酰胺菌素生物合成”有关的结合物也与氨基酸生物合成有关,表明氨基酸代谢加速。此外,被下调的DEGS的“甘氨酰鞘脂合成”和其他富集途径表明,CO2处理对细胞壁相关代谢有很大的影响。另外,二氧化碳影响果糖、甘露糖、半乳糖和几种氨基酸的代谢。

通过实时荧光定量(qRT-PCR)验证转录组谱。1D与1DT的15个DEGs表达水平在qRT-PCR结果中显示一致的表达变化,Pearson相关系数为0.8256(图2e)。

03

30%CO2短期处理诱导细胞壁降解及HSP相关基因

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

图3草莓果实在25℃下30%CO2短期(3h)暴露对10℃贮藏过程中与贮藏相关的果实表达谱的影响

注:分别对暴露于环境空气(对照)或30%CO2(处理)后储存在0h(收获后立即),3h(在没有储存的3h处理后立即),6h,12h,1d,3d,5d,7d和10d的果实进行qRT-PCR。每个基因的名称显示在图表的顶部。数据是3个草莓果实的平均值±标准偏差(n=3)。*,**和***分别代表p <0.05,0.01或0.001的显著差异。

04

短期暴露于30%的CO2会改变蔗糖的代谢

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图4采后草莓果实GC-MS代谢产物的PLS-DA分析及载荷图

注:(a)PLS-DA评分图和(b)载荷图是使用MetaboAnalyst 3.0创建。采用3个草莓果实(n=3)进行分析。

用GC-MS对40种代谢产物进行检测和定量分析,确定CO2所致代谢变化之间的关系,并进行PLS-DA(图4)。第一和第二主成分占数据集方差的67%,但第一主成分(PC1)的样本分离最高,占方差的58.2%。在10℃贮藏期间,0D组、1D组和1DT组果实的代谢谱均发生了变化,并有明显的分离(图4a)。这与图中所示的结果是一致的,表明CO2处理对草莓果实的代谢状况有一定的影响。

图4b显示了PLS-DA的负载代谢物在投射(VIP)评分中显示出可变的重要性。CO2处理果实中抗坏血酸和磷酸的浓度增加,这两种化合物是分离这两个类群的主要因素。细胞壁中的糖(如半乳糖、甘露糖、葡萄糖和果糖)的含量也随着CO2的暴露而变化。

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

图5采后草莓果实GC-MS代谢产物图谱

注:代谢物的颜色标度由PLS-DA的标准化数据计算。参与所示代谢谱的1D与1DT的DEGs用热图展示。根据颜色比例,左色块和右色块分别表示0D vs 1D和0D vs 1DT的每个contig的log2倍变化。

在KEGG分析的基础上,将代谢物映射到一般代谢途径,说明了处理对代谢途径的影响(图5)。二十一种代谢物(肌醇,缬氨酸,果糖,甘油,木糖,抗坏血酸,硬脂酸,苹果酸,柠檬酸,天冬氨酸,苏氨酸,天冬酰胺,甘氨酸,丙氨酸,苏糖酸,谷氨酰胺,谷氨酸,葡萄糖,奎尼酸,琥珀酸和阿拉伯糖)在1DT样品中增加,葡萄糖,奎尼酸,琥珀酸和阿拉伯糖显著增加。细胞壁组分的前体阿拉伯糖(Arabinose)和莽草酸(Shikimicacid)的衍生物奎尼酸(Quinicacid)值得注意(图5)。此外,四种代谢物(蔗糖、甘露糖、半乳糖和焦谷氨酸)没有增加。

根据其KEGG通路列出与代谢变化相关的候选DEGs(图5)。蔗糖的减少和葡萄糖和果糖的增加是代谢组学分析中观察到的最大变化,这部分地解释了转化酶抑制剂表达的变化。抗坏血酸脱氢酶的下调与抗坏血酸含量的增加有关。随着氨基酸水平(如谷氨酰胺、丙氨酸、甘氨酸等)的变化,许多与氨基酸合成有关的基因被差异表达。

05

短期暴露于30%的CO2可防止细胞壁超微结构的降解

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图6收获草莓果实的TEM图像

注:图像显示:(A)暴露于空气中(对照)3d的样品;(B))暴露于空气中5d的样品;(C)暴露于30%的CO2(处理)3d的样品;(D)暴露于30%的CO2 5d的样品。缩写:CW,细胞壁;ML,中间层。

为了检验所观察到的代谢变化的影响,我们用电子显微镜观察了果实的细胞壁。图6显示了草莓果实的细胞壁超微结构。3d后,对照(图6a)的中间层被分解和降解,并在贮藏5d时观察到细胞壁之间的空隙(图6b)。相反,在CO2处理的果实中,中层结构保持在3d(图6C),相邻细胞之间的细胞壁在5d时保持附着(图6d)。

果胶是细胞壁的主要成分,果胶的降解是果实软化的主要原因。由于CO2处理的果实仍然结实(图1c),我们检测了细胞壁中不溶性果胶的多糖醛酸苷(Polyuronide,不溶性果胶)含量。贮藏过程中CO2处理果实中的多糖醛酸苷含量较高(图7)。3d后,对照和处理果实中多糖醛酸苷含量分别为18.3和29.6g kg-1。这些结果与果实硬度的结果一致(图1c)以及细胞壁降解酶的表达水平(图3a-c)。

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

图7草莓果实在25℃下30%CO2短期暴露对10℃贮藏过程中不溶性果胶含量的影响

注:在25℃下,水果暴露于环境空气(对照)或30%CO2(处理)3h。数据为3个草莓果实的均值±标准差(n=3)。*和*分别在p<0.05或0.01时有显著性差异。


综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
总结
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

本研究记录了暴露于30%CO2处理3h后草莓果实中发生的转录组学和代谢组学变化。了解这种处理诱导的细胞反应和分子机制有助于改善或发展生态友好的采后技术,并提供基本知识,以识别对CO2高度响应的基因,从而培育具有更好耐贮性的草莓品种。

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