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    发布时间: 2019 - 03 - 13
    合作单位:江苏大学食品与生物工程学院发表期刊:Food Chemistry影响因子:4.946(SCI二区)研究背景:桔霉素(citrinin,CIT)是一种次生代谢物,最初由桔青霉Penicillium citrinum生产。后来发现它是由曲霉属、红曲属、青霉属等产生的。一些农业食品中报告了CIT的污染情况,包括大米、奶酪、小麦、苹果和其他商业食品。食品中的CIT污染不仅造成重大经济损失,而且对人们构成肾毒性威胁。实验目的:比较10μg/mL CIT处理和不处理Cryptococcus podzolicus Y3的转录和蛋白质组,以揭示酵母对CIT的防御反应及CIT降解的分子机制。实验取材:CIT处理和不处理Cryptococcus podzolicus Y3酵母菌株组学:转录组学和蛋白组学主要研究成果01蛋白的差异表达分析在每个凝胶中总共检测到102个差异表达的蛋白质(平均fold change>1.2)。其中42个差异显著表达蛋白(平均fold change2,p2,p02差异表达蛋白的WEGO分类对所有已鉴定的蛋白质进行了GO功能注释分析,其中被鉴定为细胞和代谢过程的蛋白质为第1位,其次是生物调节和对刺激的反应。所涉及的许多细胞成分是细胞器、细胞成分和生物大分子。结合和催化功能是分子功能中识别最多的蛋白质,其次是抗氧化蛋白、电子携带蛋白、转运蛋白等。03基因的差异表达分析共获得了43928个转录物和17088个unigenes,其N50值分别为2844和2219(补充表S2)。所有基因均用BLAST软件进行注释,其中包括NR、Swissprot、GO、COG、KOG、Pfam和KEGG数据库。共有14550个基因被注释到数据库中。检测所有基因的表达水平,共获得1409个差异表达基因(DEGS,fold change2,p04基因的GO分类根据细胞...
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    发布时间: 2019 - 03 - 11
    摘要草莓属配子体不亲和系统的研究已经广为人知了,但是其遗传机制目前仍是未知的。通过人工自花授粉获得了11个不同亲和性的第二世代绿色草莓,用来代表不同的坐果率水平。本研究对两个较大差异坐果率的自交系进行全基因组重测序,Ls-S2-53(自交不亲和)和Ls-S2-76(强自交亲和)。利用完全自交亲和的野草莓作为参考样品,进行两个绿色草莓全基因组变异检测和注释分析。两测序样品间每条染色体上的多态分布都很相似,但是纯合变异的数量和分布区域是不一致的。基因表达分析表明6个和自交不亲和显著相关的候选基因,用野草莓基因组作为参考,将一个FIP2-like(肌动蛋白骨架合成相关)作为两个自交不亲和自交系的候选基因,该基因编码的肽链在两个材料中均存在不同长短的数量的氨基酸数量的丢失。通过抑制FIP2-like的表达减少了花粉管顶端F-actin的合成,在一定程度上抑制了花粉粒的生成和花粉管的发育。研究结果表明差异的纯合变异分布影响了绿色草莓的果实坐果率,完整编码的FIP2-like能够正常促进F-actin的合成,而较短氨基酸序列的FIP2-like对两个自花授粉草莓的亲和性有影响。材料方法植物材料:F.viridis 42,Ls-S1-2,11个Ls-S1-2自交系;测序材料:Ls-S2-53,Ls-S2-76(幼嫩叶片);Ls-S2-53人工自花授粉后(0h)叶、花梗、花萼、花瓣、雌蕊、花药用来做组织特异表达分析,雌蕊自花授粉后(6,12,24,48,72h)做时空表达分析。测序策略:Illumina Hiseq 2500,Ls-S2-53(80X),Ls-S2-76(75X)。参考基因组:F. vesca reference genome v2.0.a1;比对参考基因组:BWA v0.6.1,过滤冗余序列:SAMtools,变异检测:GATK,变异位点注释:SnpEff,基因功能注释:...
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    发布时间: 2019 - 01 - 29
    小基因组测序,等待您的加入!客户发表文章:”The Complete Plastid Genome of Magnolia zenii and Genetic Comparison to Magnoliaceae species“        壹俺们很优秀,无奈太低调,悄悄告诉您,俺们公司客户叶绿体文章又有一篇发表啦!集思慧远带着自主研发的叶绿体组装软件为您科研道路上添砖加瓦!下面小编就带您看看,一篇叶绿体文章如何造就!贰                      宝华玉兰的完整质体基因组及其与木兰科植物的遗传比较                           IF=3.098宝华玉兰是一种极度濒危物种,仅存于中国江苏省宝华山有18棵。关于它的分子生物学的信息很少,直到现在还没有对宝华玉兰进行质体基因组研究。本文通过对宝华玉兰(Magnolia Zenii)的完整叶绿体基因组进行测序组装,鉴定SSR,并通过对近缘物种基因组结构和序列数据的比较分析,揭示了5个突变热点,对今后木兰科的系统发育和进化研究具有重要意义。这篇文章的研究内容如下:1、叶绿体基因组组装宝华玉兰基因组长160,048 bp,GC含量为39.2%,包括一对26,596 bp的反向重复区(IRA和IRB),一个大单拷贝区(LRC)88,098 bp,一个小单拷贝区(SSC)18,757 bp.2、木兰科物种叶绿体基因组比较分析用28种木兰科物种和2种鹅掌楸的叶绿体基因组进行序列比对。宝华玉兰的叶绿体基因组放...
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    发布时间: 2019 - 01 - 28
    摘要油菜是一种重要的油料作物,为了适应不同的气候带和纬度,形成了三种主要的生态型(冬性,半冬性,春性)。这些生态型多样性背后的遗传机制目前还是未知的。本研究这对收集的世界各地的991份资源品种进行全基因组重测序并分析了这些资源的遗传多样性。测序结果分别和油菜“Darmor-bzh”,“Tapidor”基因组比对鉴定到5.56M/5.53M SNPs,1.86M/1.92M Indels。文章通过构建等位基因漂变图揭示主要群落的,利用遗传多样性和连锁不平衡参数研究了甘蓝型油菜两个亚基因组的非对称进化。选择性清除分析表明了调控各种植物发育和胁迫的直系同源基因间的遗传多样性。全基因组关联分析发现在FT和FLC同源基因的启动子区域的SNP,符合不同生态型的油菜。材料方法实验材料:来自39个国家,658种冬性、145种半冬性、188种春性油菜。测序策略:Illumina HiSeq Xten PE150,共7.9T(平均测序深度6.6X)。油菜参考基因组:‘‘Darmor-bzh’’ genome (B. napus v4.1 genome),‘‘Tapidor’’genome。系统发育分析:MEGA5.2(NJ树,Kimura 2-parameter model);LD分析:PLINK,群体结构:ADMIXTURE;PCA:EIGENSOFT(smartPCA)。SNP重组率计算:R package FastEPRR;等位基因漂移分析:TREEMIX,基因流画图:R package ggplot2。选择性清除:PopGenome(Fst),XP-CLR;关联分析:TASSEL(MLM)。研究结果1、991份油菜资源群体结构和遗传变异A/B.991份油菜资源全球分布情况及对应三种生态型;C.991份材料的系统进化分析(与油菜生态型大致相同);D.群体主成分分析,PC1能够区分冬性和半...
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    发布时间: 2018 - 12 - 13
    发表期刊:Postharvest Biology and Technology影响因子:IF=3.112(SCI二区)研究背景草莓(Fragaria×ananassa Duch.)由于其独特的风味和多汁的质地,是一种在世界范围内广受欢迎的园艺作物。它是维生素C和抗氧化剂的良好来源,但由于软化快、机械损坏、真菌腐烂和采后代谢迅速,很容易腐烂。在6℃贮藏1d后,草莓果实中的蔗糖水平由于快速的采后代谢而达到无法检测的水平。虽然草莓品种的贮藏期不同,但平均贮藏期通常只有3-5d。先前研究报道了CO2诱导的生理和机械变化,收获后,草莓果实中含有较高水平的二氧化碳(CO2)以提高可储存性。暴露于20%CO2中12或48h的草莓果实比在环境空气中贮藏3d的水果更结实。高浓度的二氧化碳会影响细胞壁钙的结合,提高果实的硬度。为了深入了解高浓度CO2在分子和生化水平上的影响,多学科方法是必要的。整合基因组学、蛋白质组学和代谢组学将有助于更好地理解植物对外界刺激的全面定性和定量反应。尽管对草莓果实采后对高CO2的响应进行了研究,但对细胞反应的全面了解仍不甚清楚。本研究联合转录组学和代谢组学方法来研究分子和细胞反应,将收获的草莓果实短期暴露于30%CO2,以全面了解改善的果实耐贮性。材料与方法01植物材料与CO2处理草莓于80%红色收获,收获后,果实立即运往实验室。选择大小和颜色一致的果实作为试验材料。分组:0D:环境空气0h(收获后立即)1D:3h环境空气处理后1d1DT:3h 30%CO2处理后1d 02硬度测定随机抽取3个重复容器中的10个草莓果实进行硬度测定(n=30),经硬度测定后丢弃。采用CT-3纹理分析仪进行硬度测量。用直径为100mm、速度为2mm、应变为5mm、直径为100 mm的平板探针,在果实赤道面测量果实硬度(N)。草莓果实表面微生物...
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    发布时间: 2018 - 12 - 13
    集思慧远客户发表——《王枣子根、茎和叶的比较转录组分析揭示了王枣子素生物合成的候选基因》英文标题:Comparative transcriptome analysis of roots, stems and leaves Isodon amethystoides reveals candidate genes involved in Wangzaozins biosynthesis杂志:BMC PLANT BIOLOGY影响因子:IF=3.930摘要    王枣子是一种重要的中药植物,具有治疗多种疾病的药理作用,包括肺结核。四环二萜类化合物王枣子素(王枣子甲素Wang zaozin A,王枣子乙素GlucocalyxB)是王枣子的主要生物活性化合物。然而,关于这些化合物生物合成的分子信息仍然不清楚。通过对王枣子中王枣子素积累水平的研究,发现该植物的根、茎和叶组织有很大的变化,表明不同组织间代谢产物生物合成和积累的可能存在差异。为了更好地阐明四环二萜生物合成途径,我们对根、茎和叶组织进行转录组测序,并进行了de novo序列组装和分析。分析了与二萜类生物合成有关的候选基因,如CPS、KSL等。用qRT-PCR方法对8种涉及四环二萜类生物合成的转录本在王枣子不同组织中的表达谱进行了验证,解构该通路的基因表达谱。ISPD、ISPF和ISPH(MEP途径)以及IaCPS和IaKSL(二萜类途径)候选基因在叶片和根中的差异表达,可能是造成王枣子叶片中王枣子素积累较高的原因之一。本文报道的基因组数据和分析为进一步研究这一重要药用植物奠定了基础。材料与方法植物材料:一年生健康王枣子个体的根、茎、叶(3个重复)王枣子素的提取与鉴定(靶标代谢):种类:王枣子甲素、王枣子乙素和王枣子丙素        &...
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综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

日期: 2018-12-13
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综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

发表期刊:Postharvest Biology and Technology

影响因子:IF=3.112(SCI二区)


综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
研究背景
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

草莓(Fragaria×ananassa Duch.)由于其独特的风味和多汁的质地,是一种在世界范围内广受欢迎的园艺作物。它是维生素C和抗氧化剂的良好来源,但由于软化快、机械损坏、真菌腐烂和采后代谢迅速,很容易腐烂。在6℃贮藏1d后,草莓果实中的蔗糖水平由于快速的采后代谢而达到无法检测的水平。虽然草莓品种的贮藏期不同,但平均贮藏期通常只有3-5d。先前研究报道了CO2诱导的生理和机械变化,收获后,草莓果实中含有较高水平的二氧化碳(CO2)以提高可储存性。暴露于20%CO2中12或48h的草莓果实比在环境空气中贮藏3d的水果更结实。高浓度的二氧化碳会影响细胞壁钙的结合,提高果实的硬度。

为了深入了解高浓度CO2在分子和生化水平上的影响,多学科方法是必要的。整合基因组学、蛋白质组学和代谢组学将有助于更好地理解植物对外界刺激的全面定性和定量反应。尽管对草莓果实采后对高CO2的响应进行了研究,但对细胞反应的全面了解仍不甚清楚。本研究联合转录组学和代谢组学方法来研究分子和细胞反应,将收获的草莓果实短期暴露于30%CO2,以全面了解改善的果实耐贮性。

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应


综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
材料与方法
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
01

植物材料与CO2处理

草莓于80%红色收获,收获后,果实立即运往实验室。选择大小和颜色一致的果实作为试验材料。

分组:

0D:环境空气0h(收获后立即)

1D:3h环境空气处理后1d

1DT:3h 30%CO2处理后1d 

02

硬度测定

随机抽取3个重复容器中的10个草莓果实进行硬度测定(n=30),经硬度测定后丢弃。采用CT-3纹理分析仪进行硬度测量。用直径为100mm、速度为2mm、应变为5mm、直径为100 mm的平板探针,在果实赤道面测量果实硬度(N)。


草莓果实表面微生物测定

随机抽取3个重复容器中的1个草莓果实进行微生物分析(n=3)。用3M膜好氧计数板或3M膜酵母和霉菌计数板(3M)培养果实表面微生物,评价CO2的杀菌效果。


不溶性果胶测定

采用细胞壁提取液进行不溶性果胶(insoluble pectin)测定。随机抽取3个重复容器中的1个果实进行检测(n=3)。用Multiple Plate Reader(Perkin Elmer,Waltham,MA,USA)在525nm处测定吸光度。


透射电镜

分别于3d和5d采摘新鲜草莓果实,将果实肩部切成1mm长的三角形,组织切成1-2mm厚的切片,进行透射电镜(TEM)观察。

03
转录组学

检测平台:HiSeq 2500 PE250bp

生物信息学分析:CLC Genomics Workbench ver. 3.7.1;Trinity ver. 2.0.2;Velvet ver. 1.1.04;Oases ver. 0.1.21用于基因组装;Blast2GO ver. 2.6.5用于GO注释;KEGG以及Mapman 3.6.0用于差异基因功能注释。


代谢组学

检测平台:GC-MS ISQ LT system

生物信息学分析:MetaboAnalyst 3.0用于树状图构建、热图聚类分析、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)以及及代谢途径分析。



综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
主要研究结果
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

01

短期暴露于30%CO2可以减少水果腐烂

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

1.草莓果实在25°C30%CO2短期(3h)暴露对10°C贮藏期间果实品质的影响

注:(a)贮藏后10d暴露于周围空气(对照,左)和30%CO2(处理,右)下的水果外观;(b)水果腐烂;(C)果实硬度。在贮藏后0h(采收后立即)、3h(贮藏3h后)、6h、12h、1d、3d、5d、7d和10d分别测定果实硬度。对于果实腐烂,数据是三个重复的均值±标准差。就果实硬度而言,数据是30个草莓果实的平均值±标准差(n=30)。

30%CO2处理的草莓果实的灰霉病比周围空气处理的少(图1a)。对照果实在贮藏5d后开始腐烂,CO2处理减少了果实贮藏期间的腐烂。处理后10d,27%的对照果实腐烂,而CO2处理的果实只有19%腐烂(图1b)。为了评价CO2的抗菌效果,我们测定了对照表面的微生物数量,并对处理后3h后的果实样品进行了处理,两组结果无显著性差异。这证实了CO2处理的果实的减少的腐烂和可储存性的改善不是由于消毒效果,而是由果实中CO2处理诱导的细胞反应或CO2对胶束生长和孢子萌发的直接抑制作用。

CO2处理还表现出果实在10℃贮藏期间软化的延迟(图1c),收获期果实硬度为10.25N,随着贮藏时间的延长,空气处理对照果实硬度为7.9N,CO2处理草莓果实硬度为9.16N。贮藏1d至10d,CO2处理与对照果实硬度差异显著,3、5d果实硬度最高。

02

DEGs在细胞壁和次生代谢相关的途径中富集

综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

2 DEG数和DEG相关性

注:(a)0D vs 1D,0D vs 1DT和1D vs 1DT样品的上调DEG的维恩图。(b)下调的DEGs的维恩图。(c)在0D与1D和0D与1DT之间共同上调的958个DEGs的Pearson相关系数。(d)在0D与1D和0D与1DT之间共同下调的1407个DEGs的Pearson相关系数。(e)在1D与1DT中RNA测序和qRT-PCR数据之间表达水平的Pearson相关系数。

本研究对0D,1D和1DT草莓果实的转录组进行了进一步分析,以阐述草莓果实短期暴露于30%的CO2受到的细胞反应。GO分析结果显示,大多数(96%)被注释。0D vs 1D检测到3750个contigs差异表达(1643个上调,2107个下调)(图2a,b);1Dvs 1DT检测到958个上调基因和1407个下调基因。这些DEGs占0D与1DT的DEG的50%和0D与1D的DEG的63%(图2a,b),表达模式与较高的Pearson相关系数一致(图2c,d)。从1D和1DT之间的比较中特异性检测到的325个上调基因和216个下调基因用于研究30%CO2的影响。

1D vs 1DT的DEGs的富集KEGG路径不同于0D vs 1DT的DEGs的KEGG路径,显示了30%CO2处理的效果,根据Fisher的精确测试,其中“嘧啶代谢”和“甘氨酰鞘脂生物合成”分别在上调的DEGs和在下调的DEGs中显著富集,具有最高的意义。大多数与“嘧啶代谢”和“单酰胺菌素生物合成”有关的结合物也与氨基酸生物合成有关,表明氨基酸代谢加速。此外,被下调的DEGS的“甘氨酰鞘脂合成”和其他富集途径表明,CO2处理对细胞壁相关代谢有很大的影响。另外,二氧化碳影响果糖、甘露糖、半乳糖和几种氨基酸的代谢。

通过实时荧光定量(qRT-PCR)验证转录组谱。1D与1DT的15个DEGs表达水平在qRT-PCR结果中显示一致的表达变化,Pearson相关系数为0.8256(图2e)。

03

30%CO2短期处理诱导细胞壁降解及HSP相关基因

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图3草莓果实在25℃下30%CO2短期(3h)暴露对10℃贮藏过程中与贮藏相关的果实表达谱的影响

注:分别对暴露于环境空气(对照)或30%CO2(处理)后储存在0h(收获后立即),3h(在没有储存的3h处理后立即),6h,12h,1d,3d,5d,7d和10d的果实进行qRT-PCR。每个基因的名称显示在图表的顶部。数据是3个草莓果实的平均值±标准偏差(n=3)。*,**和***分别代表p <0.05,0.01或0.001的显著差异。

04

短期暴露于30%的CO2会改变蔗糖的代谢

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图4采后草莓果实GC-MS代谢产物的PLS-DA分析及载荷图

注:(a)PLS-DA评分图和(b)载荷图是使用MetaboAnalyst 3.0创建。采用3个草莓果实(n=3)进行分析。

用GC-MS对40种代谢产物进行检测和定量分析,确定CO2所致代谢变化之间的关系,并进行PLS-DA(图4)。第一和第二主成分占数据集方差的67%,但第一主成分(PC1)的样本分离最高,占方差的58.2%。在10℃贮藏期间,0D组、1D组和1DT组果实的代谢谱均发生了变化,并有明显的分离(图4a)。这与图中所示的结果是一致的,表明CO2处理对草莓果实的代谢状况有一定的影响。

图4b显示了PLS-DA的负载代谢物在投射(VIP)评分中显示出可变的重要性。CO2处理果实中抗坏血酸和磷酸的浓度增加,这两种化合物是分离这两个类群的主要因素。细胞壁中的糖(如半乳糖、甘露糖、葡萄糖和果糖)的含量也随着CO2的暴露而变化。

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图5采后草莓果实GC-MS代谢产物图谱

注:代谢物的颜色标度由PLS-DA的标准化数据计算。参与所示代谢谱的1D与1DT的DEGs用热图展示。根据颜色比例,左色块和右色块分别表示0D vs 1D和0D vs 1DT的每个contig的log2倍变化。

在KEGG分析的基础上,将代谢物映射到一般代谢途径,说明了处理对代谢途径的影响(图5)。二十一种代谢物(肌醇,缬氨酸,果糖,甘油,木糖,抗坏血酸,硬脂酸,苹果酸,柠檬酸,天冬氨酸,苏氨酸,天冬酰胺,甘氨酸,丙氨酸,苏糖酸,谷氨酰胺,谷氨酸,葡萄糖,奎尼酸,琥珀酸和阿拉伯糖)在1DT样品中增加,葡萄糖,奎尼酸,琥珀酸和阿拉伯糖显著增加。细胞壁组分的前体阿拉伯糖(Arabinose)和莽草酸(Shikimicacid)的衍生物奎尼酸(Quinicacid)值得注意(图5)。此外,四种代谢物(蔗糖、甘露糖、半乳糖和焦谷氨酸)没有增加。

根据其KEGG通路列出与代谢变化相关的候选DEGs(图5)。蔗糖的减少和葡萄糖和果糖的增加是代谢组学分析中观察到的最大变化,这部分地解释了转化酶抑制剂表达的变化。抗坏血酸脱氢酶的下调与抗坏血酸含量的增加有关。随着氨基酸水平(如谷氨酰胺、丙氨酸、甘氨酸等)的变化,许多与氨基酸合成有关的基因被差异表达。

05

短期暴露于30%的CO2可防止细胞壁超微结构的降解

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图6收获草莓果实的TEM图像

注:图像显示:(A)暴露于空气中(对照)3d的样品;(B))暴露于空气中5d的样品;(C)暴露于30%的CO2(处理)3d的样品;(D)暴露于30%的CO2 5d的样品。缩写:CW,细胞壁;ML,中间层。

为了检验所观察到的代谢变化的影响,我们用电子显微镜观察了果实的细胞壁。图6显示了草莓果实的细胞壁超微结构。3d后,对照(图6a)的中间层被分解和降解,并在贮藏5d时观察到细胞壁之间的空隙(图6b)。相反,在CO2处理的果实中,中层结构保持在3d(图6C),相邻细胞之间的细胞壁在5d时保持附着(图6d)。

果胶是细胞壁的主要成分,果胶的降解是果实软化的主要原因。由于CO2处理的果实仍然结实(图1c),我们检测了细胞壁中不溶性果胶的多糖醛酸苷(Polyuronide,不溶性果胶)含量。贮藏过程中CO2处理果实中的多糖醛酸苷含量较高(图7)。3d后,对照和处理果实中多糖醛酸苷含量分别为18.3和29.6g kg-1。这些结果与果实硬度的结果一致(图1c)以及细胞壁降解酶的表达水平(图3a-c)。

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图7草莓果实在25℃下30%CO2短期暴露对10℃贮藏过程中不溶性果胶含量的影响

注:在25℃下,水果暴露于环境空气(对照)或30%CO2(处理)3h。数据为3个草莓果实的均值±标准差(n=3)。*和*分别在p<0.05或0.01时有显著性差异。


综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
总结
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应
综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应

本研究记录了暴露于30%CO2处理3h后草莓果实中发生的转录组学和代谢组学变化。了解这种处理诱导的细胞反应和分子机制有助于改善或发展生态友好的采后技术,并提供基本知识,以识别对CO2高度响应的基因,从而培育具有更好耐贮性的草莓品种。

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2019 - 01 - 28
摘要油菜是一种重要的油料作物,为了适应不同的气候带和纬度,形成了三种主要的生态型(冬性,半冬性,春性)。这些生态型多样性背后的遗传机制目前还是未知的。本研究这对收集的世界各地的991份资源品种进行全基因组重测序并分析了这些资源的遗传多样性。测序结果分别和油菜“Darmor-bzh”,“Tapidor”基因组比对鉴定到5.56M/5.53M SNPs,1.86M/1.92M Indels。文章通过构...
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