Hi-C:技术源于基因组捕获技术（Chromosomeconformationcapture），以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系。作为国自然热点前沿技术，Hi -C技术被广泛应用于研究三维基因组结构和表观遗传调控，通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获，以获得全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系与相互作用模式、高分辨率的染色质三维结构信息。

Hi-C实验具体流程

产品优势：

分辨率高、All to all、全景式捕获所有染色体内/间的相互作用，应用范围广泛（辅助基因组组装）

送样要求：

分析内容：

(1) 测序数据质量评估；

(2) 测序数据与参考基因组序列比对；

(3) 互作图谱构建；

(4) 测序数据质量情况汇总；

(5) AB compartment分析；

(6) 全基因组三维结构重构及可视化；

(7) TAD分析、单体型分析、loops分析（高级分析）；

结果展示：

图1 基因组的三维空间结构展示

图2 TAD及TAD边界在基因组上分布比例图

图3 差异TAD边界区域维恩图

1. Hi-C解析手指畸形的具体机制

主要研究内容：

1）染色体变异（倒位、缺失、重复）会引起基因组三维结构的变化；

2）重塑TAD边界，导致调控元件与基因互作发生变化，造成手指畸形（短指、并指、多指等）

2. Hi-C绘制水稻的全基因组染色体的互作\

主要研究内容：

1）水稻的染色质互作模式总体上与拟南芥相似，但在特定结构水平存在明显差异；

2）基因组组成、表观遗传修饰和转录活性可能共同作用，塑造水稻的全局及局部染色质互作模式；

3）本研究结果既验证了近期在水稻和拟南芥中的相关发现，也为高等植物染色质组织的模式与特征提供了新的见解。