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线粒体基因组测序

发布日期:2019-09-17 浏览次数:1132

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       线粒体是真核生物的重要细胞器,是生物体的能量工厂,参与能量代谢、信号转导、细胞凋亡等许多生命活动,对生物的生理活动起着至关重要的作用。大部分线粒体基因由于其母系遗传特性以及进化速率较快等特点,被广泛地用于种群遗传学进化生物学谱系地理学系统发育学疾病诊断等学科领域。线粒体全基因组在生物进化的研究中具有独特的优势。由于线粒体有着与真核生物长期共生的进化历史,因此其基因组包含了反映物种进化的关键信息,同时,相对于核基因组,线粒体基因组,容对大量物种进行横向的比较分析,有于生物进化的研究,因而受到进化生物学家的钟爱。线粒体的组成可以从两个层面上反映物种及群体的遗传和进化,即核酸序列组成和基因组的结构特征,两者的特征具有不同的进化机制和进化速度,在进化生物学研究中可以很好的互补

       采用NGS高通量技术进行线粒体基因组测序分析,大大简化了技术流程,同时缩短了项目周期,是目前获取线粒体全基因组序列最主流的方法。线粒体基因组的信息分析内容十分,通过基因组注释进行基因序列组成分析来研究物种的功能特征,通过比较基因组学研究物种间基因组结构变化探讨物种的环境适应性特征,通过群体基因组研究的内容就更加宽广:物种起源、亲缘分类、系统发育、谱系地理等。对于发文章来讲线粒体基因组分析可描述的点很多,但同时又非常套路,所以发起文章来就轻轻松松。线粒体基因组信息分析技术流程如下所示:



线粒体基因组测序产品优惠活动如下:


活动一、单个项目金额(或预付款)达10000,赠送价值500备用金(有效期一年),满10000送500抵用劵,依次类推,不设上限···(我们不打折,我们直接送“钱”)

活动二、单个项目金额(或预付款)达10000以上,可以选择备用金等额项目服务(测序,定量等)

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不同以往,不同其他公司,此次参与优惠活动的产品是集思慧远所有的服务项目(总有一款适合您)!!!

本次活动时间为2019年9月17日至2019年10月30日,活动最终解释权归南京集思慧远生物科技有限公司所有。




       案例一 分月扇舟蛾线粒体基因组测序研究夜蛾总科系统发育|IF=4.784

       通过对分月扇舟蛾线粒体测序分析,得到全长15390bp的线粒体基因组序列;基因注释得到13个蛋白编码基因,2个rRNA基因,22个tRNA基因和一个非编码控制区;发现了经典的trnM重排现象;控制区鉴定了一个“ATAGA+poly-T”的保守结构域;线粒体AT含量较高等现象。用13个PCGs进行5个科的进化树分析优化了夜蛾总科的系统发育关系: (Notodontidae+(Erebidae+(Nolidae+(Euteliidae+Noctuidae)))),同时也支持了分月扇舟蛾属于舟蛾科的观点。


       【参考文献】Xiao-Yu Zhu,Zhao-Zhe Xin , et al. The complete mitochondrial genome of Clostera anastomosis (Lepidoptera: Notodontidae) and implication for the phylogenetic relationships of Noctuoidea species ,International  Journal of  Biological Macromolecules  2018. doi:10.1016/j.ijbiomac.2018.06.188


       案例二 黄颡鱼线粒体测序研究鲿科系统发育关系|IF=3.16

       通过对黄颡鱼基因组测序获得黄颡鱼全长线粒体基因组序列共16526bp,其中获得13个编码蛋白基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因,一个非编码控制区(D-loop)。基于BI法和ML法构建系统进化树分析,发现黄颡鱼和长须黄颡鱼有着较近的亲缘关系,支持属于鲿属的分类。本研究证实鲿属、黄颡鱼属、鮠属不是一个类群,但是三者形成了一个更大的分类群,为进一步研究鲿科的系统发育提供了参考。


       【参考文献】Yu Liu, Pei-Dong Wu, et al. (2018), Mitochondrial genome of the yellow catfish Pelteobagrus fulvidraco and insights into Bagridae phylogenetics. Genomics. doi:10.1016/j.ygeno.2018.08.005