在高等生物细胞内除了细胞核遗传外，细胞质遗传也是很重要的一方面，其主要物质是——线粒体和叶绿体。然而由于受到各项技术的限制一直以来研究的甚少。随着高通量测序技术的发展和生物信息算法的改进，越来越多的动植物线粒体和叶绿体基因组被破译组装出来。由于细胞器基因组序列也能为研究生物的分子生态及进化提供重要的遗传信息，因此细胞器基因组测序也掀起了新的科研热潮。

结果分析展示

麻栎叶绿体基因组基因组圈图

叶绿体基因组结构比较

叶绿体基因组IR边界的收缩与扩张分析

原文链接：https://www.mdpi.com/1422-0067/19/8/2443

叶绿体样本准备

     植物叶绿体基因组是植物细胞中重要的细胞器，单独分离出叶绿体十分不易，所以目前提出全基因组测序。而在实际取样过程中，我们得到的植物样本（叶片等）中，不仅有我们关注的细胞器基因组部分，还会有大量核基因组的干扰，这就需要我们有针对性的准备样本，而最关键的就是叶绿体的富集。

     在这里给您分享植物进行叶绿体基因组研究的材料准备：

首先不要黄化苗。黄化苗中缺少叶绿素，不能进行光合作用，含叶绿体数量少；

其次取样在植物生长发育旺盛时期；

最后在开始取样前的时候给予植株充足的光照（至少6h左右），以确保有足够的叶绿体生成。

样本量大小：（样品需干冰运送）

    1. 若提供叶片等绿色组织，需样本量≧200mg；

    2. 若提供DNA，需DNA总量≧5μg；纯度OD260/280在1.8-2.0之间（附加电泳图一张）。注：DNA完整无降解，无RNA、蛋白质等污染。