基因家族在染色体上的位置图绘制利器

       今天向各位童靴推荐一个可在线绘制基因染色体位置图的工具—MapGene2Chrom。MapGene2Chrom相比Gbrowse、MapViewer等工具输入数据格式简单，输出结果易于修改，且图片格式为SVG矢量图，具有很好的移植性。

       MapGene2Chrom有本地版与网页版，一般网页版就可以满足要求，网址：http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/。目前MapGene2Chrom已经由最初的v1.0版本更新为v2.1版本，下面小编就以最新的v2.1版本演示MapGene2Chrom的使用方法。

step1 

       数据准备打开网页，右边的两个方框内是需要输入的数据：1.家族中基因的信息，从左到右依次为：基因的ID，基因的起始位置，基因的终止位置，该基因所在的染色体ID，最后一列是非必需的，可选择性设置该基因ID显示的颜色如black，blue等；2基因所在染色体的信息（注意：只需要输入1中所有基因所在的染色体ID并集，并不需要输入该物种所有的染色体信息），从左到右依次为：染色体ID，染色体序列的长度。

step2 

       一键化绘图将Step1中的两部分数据输入后点击下方的DRAW（为保护客户资料，小编以网站的示例数据演示），就可出现下方的基因染色体位置图，右边的方框中有几条染色体，下方就会出现几条，并且会自动显示染色体长度的标尺（单位kb），在每条染色体上标记了对应位置的基因ID，其中字体的颜色是由左上方输入文件的最后一列决定，默认是黑色（black）。

step3 

       个性化设置Step2中生成的图片是默认格式，若满足你的要求可右键点击图片下方保存SVG格式图片。但许多时候我们还想来点不一样的设置，MapGene2Chrom能不能办到呢?答案当然是YES！请看网页左边的parameters setting，包含针对染色体id字体颜色，SVG的尺寸等的设置。小编根据自己喜好设置后的位置图见下方右图。

       在基因家族分析中，基因的染色体位置图表现形式简洁明了，易于观看。MapGene2Chrom的绘图速度较快，且操作简单。童靴们快动手试试吧！