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科技服务 / Technology service

iTRAQ定量蛋白质组学

发布日期:2019-03-11 浏览次数:1345

  • 产品简介
  • 内容分析
  • 案例分析
  • 常见问题

  主要针对翻译产物蛋白质进行高通量测序,可全面快速获得细胞、组织或者完整生物个体的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态等,用于研究蛋白质之间的相互作用与联系,在整体水平上研究蛋白质的组成与调控活动规律。目前已广泛应用于生物学研究、农业、医学等多个领域,主要研究技术有高分辨质谱的标记( SILAC 、 ITRAQ /TMT )与非标记( label-free )定量定性技术等。


  应用领域:

  蛋白质的鉴定

  翻译后修饰

  蛋白质功能

  药物靶向蛋白质和疾病标志物发现


  产品优势:

  高通量,可同时对8/10个样本进行分析,提高了实验通量

  分析范围广,可对任何类型的蛋白质进行鉴定

  高灵敏度,检测限低,可检测出低丰度蛋白

  专业的定制化信息分析服务


  技术路线:




  分析内容:

  蛋白质组鉴定;

  Unique肽段数分布;

  肽段长度分布;

  肽段质量误差分布;

  蛋白覆盖度分布;

  定量信息统计;

  蛋白质丰度比(FC)分布;

  差异蛋白质的功能注释(两个或以上样品);

  差异蛋白质的GO和KEGG富集分析(两个或以上样品);

  差异蛋白质互作网络。


  研究路线:


  样品要求:

  1.样品类型:总蛋白;

  2.样品总量:>500mg(新鲜组织样); >300ug-500ug(提取蛋白量)。

  3.样品重复:三个生物重复或技术重复

  1、利用蛋白组方法分析水稻根系的耐铝机制

  本研究以两种不同耐受铝程度的粳稻品种: “日本晴” 和‘7098’在12小时和24小时Al3+处理后,取根尖2-3cm的部分进行蛋白组测序。通过比较“日本晴” 和‘7098’发现106个蛋白质在敏感和耐受的水稻品种中显着改变,其中在敏感的'7098'中有62种蛋白质显着改变,而在耐受性'Nipponbare'植物中有76种蛋白质显着改变,两者共有32种蛋白质。本研究为不同品种植物响应胁迫处理后的差异蛋白质和代谢途径的鉴定提供了思路。

iTRAQ实验的一般工作流程


  2、iTRAQ技术进行假乳瘤蛋白组分析揭示内质网加工功能障碍

  本研究通过iTRAQ技术结合LC-MS/MS分析,筛选出1171个蛋白质,同时采用免疫组化方法对六个具有代表性的差异表达蛋白进行了验证。这是第一次进行早期SPTP蛋白质组全面分析,揭示了新的候选标志物和代谢途径,可进一步进行临床应用。


iTRAQ定量蛋白质组学内质网的蛋白加工途径的网络图


  参考文献:

  1. Wang Z Q, Xu X Y, Gong Q Q, et al. Root proteome of rice studied by iTRAQ provides integrated insight into aluminum stress tolerance mechanisms in plants[J]. Journal of proteomics, 2014, 98: 189-205.

  2. Zhu Y, Xu H, Chen H, et al. Proteomic analysis of solid pseudopapillary tumor of the pancreas reveals dysfunction of the endoplasmic reticulum protein processing pathway[J]. Molecular & Cellular Proteomics, 2014, 13(10): 2593-2603.