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    发布时间: 2019 - 03 - 13
    合作单位:江苏大学食品与生物工程学院发表期刊:Food Chemistry影响因子:4.946(SCI二区)研究背景:桔霉素(citrinin,CIT)是一种次生代谢物,最初由桔青霉Penicillium citrinum生产。后来发现它是由曲霉属、红曲属、青霉属等产生的。一些农业食品中报告了CIT的污染情况,包括大米、奶酪、小麦、苹果和其他商业食品。食品中的CIT污染不仅造成重大经济损失,而且对人们构成肾毒性威胁。实验目的:比较10μg/mL CIT处理和不处理Cryptococcus podzolicus Y3的转录和蛋白质组,以揭示酵母对CIT的防御反应及CIT降解的分子机制。实验取材:CIT处理和不处理Cryptococcus podzolicus Y3酵母菌株组学:转录组学和蛋白组学主要研究成果01蛋白的差异表达分析在每个凝胶中总共检测到102个差异表达的蛋白质(平均fold change>1.2)。其中42个差异显著表达蛋白(平均fold change2,p2,p02差异表达蛋白的WEGO分类对所有已鉴定的蛋白质进行了GO功能注释分析,其中被鉴定为细胞和代谢过程的蛋白质为第1位,其次是生物调节和对刺激的反应。所涉及的许多细胞成分是细胞器、细胞成分和生物大分子。结合和催化功能是分子功能中识别最多的蛋白质,其次是抗氧化蛋白、电子携带蛋白、转运蛋白等。03基因的差异表达分析共获得了43928个转录物和17088个unigenes,其N50值分别为2844和2219(补充表S2)。所有基因均用BLAST软件进行注释,其中包括NR、Swissprot、GO、COG、KOG、Pfam和KEGG数据库。共有14550个基因被注释到数据库中。检测所有基因的表达水平,共获得1409个差异表达基因(DEGS,fold change2,p04基因的GO分类根据细胞...
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    发布时间: 2019 - 03 - 11
    摘要草莓属配子体不亲和系统的研究已经广为人知了,但是其遗传机制目前仍是未知的。通过人工自花授粉获得了11个不同亲和性的第二世代绿色草莓,用来代表不同的坐果率水平。本研究对两个较大差异坐果率的自交系进行全基因组重测序,Ls-S2-53(自交不亲和)和Ls-S2-76(强自交亲和)。利用完全自交亲和的野草莓作为参考样品,进行两个绿色草莓全基因组变异检测和注释分析。两测序样品间每条染色体上的多态分布都很相似,但是纯合变异的数量和分布区域是不一致的。基因表达分析表明6个和自交不亲和显著相关的候选基因,用野草莓基因组作为参考,将一个FIP2-like(肌动蛋白骨架合成相关)作为两个自交不亲和自交系的候选基因,该基因编码的肽链在两个材料中均存在不同长短的数量的氨基酸数量的丢失。通过抑制FIP2-like的表达减少了花粉管顶端F-actin的合成,在一定程度上抑制了花粉粒的生成和花粉管的发育。研究结果表明差异的纯合变异分布影响了绿色草莓的果实坐果率,完整编码的FIP2-like能够正常促进F-actin的合成,而较短氨基酸序列的FIP2-like对两个自花授粉草莓的亲和性有影响。材料方法植物材料:F.viridis 42,Ls-S1-2,11个Ls-S1-2自交系;测序材料:Ls-S2-53,Ls-S2-76(幼嫩叶片);Ls-S2-53人工自花授粉后(0h)叶、花梗、花萼、花瓣、雌蕊、花药用来做组织特异表达分析,雌蕊自花授粉后(6,12,24,48,72h)做时空表达分析。测序策略:Illumina Hiseq 2500,Ls-S2-53(80X),Ls-S2-76(75X)。参考基因组:F. vesca reference genome v2.0.a1;比对参考基因组:BWA v0.6.1,过滤冗余序列:SAMtools,变异检测:GATK,变异位点注释:SnpEff,基因功能注释:...
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    发布时间: 2019 - 01 - 29
    小基因组测序,等待您的加入!客户发表文章:”The Complete Plastid Genome of Magnolia zenii and Genetic Comparison to Magnoliaceae species“        壹俺们很优秀,无奈太低调,悄悄告诉您,俺们公司客户叶绿体文章又有一篇发表啦!集思慧远带着自主研发的叶绿体组装软件为您科研道路上添砖加瓦!下面小编就带您看看,一篇叶绿体文章如何造就!贰                      宝华玉兰的完整质体基因组及其与木兰科植物的遗传比较                           IF=3.098宝华玉兰是一种极度濒危物种,仅存于中国江苏省宝华山有18棵。关于它的分子生物学的信息很少,直到现在还没有对宝华玉兰进行质体基因组研究。本文通过对宝华玉兰(Magnolia Zenii)的完整叶绿体基因组进行测序组装,鉴定SSR,并通过对近缘物种基因组结构和序列数据的比较分析,揭示了5个突变热点,对今后木兰科的系统发育和进化研究具有重要意义。这篇文章的研究内容如下:1、叶绿体基因组组装宝华玉兰基因组长160,048 bp,GC含量为39.2%,包括一对26,596 bp的反向重复区(IRA和IRB),一个大单拷贝区(LRC)88,098 bp,一个小单拷贝区(SSC)18,757 bp.2、木兰科物种叶绿体基因组比较分析用28种木兰科物种和2种鹅掌楸的叶绿体基因组进行序列比对。宝华玉兰的叶绿体基因组放...
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    发布时间: 2019 - 01 - 28
    摘要油菜是一种重要的油料作物,为了适应不同的气候带和纬度,形成了三种主要的生态型(冬性,半冬性,春性)。这些生态型多样性背后的遗传机制目前还是未知的。本研究这对收集的世界各地的991份资源品种进行全基因组重测序并分析了这些资源的遗传多样性。测序结果分别和油菜“Darmor-bzh”,“Tapidor”基因组比对鉴定到5.56M/5.53M SNPs,1.86M/1.92M Indels。文章通过构建等位基因漂变图揭示主要群落的,利用遗传多样性和连锁不平衡参数研究了甘蓝型油菜两个亚基因组的非对称进化。选择性清除分析表明了调控各种植物发育和胁迫的直系同源基因间的遗传多样性。全基因组关联分析发现在FT和FLC同源基因的启动子区域的SNP,符合不同生态型的油菜。材料方法实验材料:来自39个国家,658种冬性、145种半冬性、188种春性油菜。测序策略:Illumina HiSeq Xten PE150,共7.9T(平均测序深度6.6X)。油菜参考基因组:‘‘Darmor-bzh’’ genome (B. napus v4.1 genome),‘‘Tapidor’’genome。系统发育分析:MEGA5.2(NJ树,Kimura 2-parameter model);LD分析:PLINK,群体结构:ADMIXTURE;PCA:EIGENSOFT(smartPCA)。SNP重组率计算:R package FastEPRR;等位基因漂移分析:TREEMIX,基因流画图:R package ggplot2。选择性清除:PopGenome(Fst),XP-CLR;关联分析:TASSEL(MLM)。研究结果1、991份油菜资源群体结构和遗传变异A/B.991份油菜资源全球分布情况及对应三种生态型;C.991份材料的系统进化分析(与油菜生态型大致相同);D.群体主成分分析,PC1能够区分冬性和半...
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    发布时间: 2018 - 12 - 13
    发表期刊:Postharvest Biology and Technology影响因子:IF=3.112(SCI二区)研究背景草莓(Fragaria×ananassa Duch.)由于其独特的风味和多汁的质地,是一种在世界范围内广受欢迎的园艺作物。它是维生素C和抗氧化剂的良好来源,但由于软化快、机械损坏、真菌腐烂和采后代谢迅速,很容易腐烂。在6℃贮藏1d后,草莓果实中的蔗糖水平由于快速的采后代谢而达到无法检测的水平。虽然草莓品种的贮藏期不同,但平均贮藏期通常只有3-5d。先前研究报道了CO2诱导的生理和机械变化,收获后,草莓果实中含有较高水平的二氧化碳(CO2)以提高可储存性。暴露于20%CO2中12或48h的草莓果实比在环境空气中贮藏3d的水果更结实。高浓度的二氧化碳会影响细胞壁钙的结合,提高果实的硬度。为了深入了解高浓度CO2在分子和生化水平上的影响,多学科方法是必要的。整合基因组学、蛋白质组学和代谢组学将有助于更好地理解植物对外界刺激的全面定性和定量反应。尽管对草莓果实采后对高CO2的响应进行了研究,但对细胞反应的全面了解仍不甚清楚。本研究联合转录组学和代谢组学方法来研究分子和细胞反应,将收获的草莓果实短期暴露于30%CO2,以全面了解改善的果实耐贮性。材料与方法01植物材料与CO2处理草莓于80%红色收获,收获后,果实立即运往实验室。选择大小和颜色一致的果实作为试验材料。分组:0D:环境空气0h(收获后立即)1D:3h环境空气处理后1d1DT:3h 30%CO2处理后1d 02硬度测定随机抽取3个重复容器中的10个草莓果实进行硬度测定(n=30),经硬度测定后丢弃。采用CT-3纹理分析仪进行硬度测量。用直径为100mm、速度为2mm、应变为5mm、直径为100 mm的平板探针,在果实赤道面测量果实硬度(N)。草莓果实表面微生物...
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    发布时间: 2018 - 12 - 13
    集思慧远客户发表——《王枣子根、茎和叶的比较转录组分析揭示了王枣子素生物合成的候选基因》英文标题:Comparative transcriptome analysis of roots, stems and leaves Isodon amethystoides reveals candidate genes involved in Wangzaozins biosynthesis杂志:BMC PLANT BIOLOGY影响因子:IF=3.930摘要    王枣子是一种重要的中药植物,具有治疗多种疾病的药理作用,包括肺结核。四环二萜类化合物王枣子素(王枣子甲素Wang zaozin A,王枣子乙素GlucocalyxB)是王枣子的主要生物活性化合物。然而,关于这些化合物生物合成的分子信息仍然不清楚。通过对王枣子中王枣子素积累水平的研究,发现该植物的根、茎和叶组织有很大的变化,表明不同组织间代谢产物生物合成和积累的可能存在差异。为了更好地阐明四环二萜生物合成途径,我们对根、茎和叶组织进行转录组测序,并进行了de novo序列组装和分析。分析了与二萜类生物合成有关的候选基因,如CPS、KSL等。用qRT-PCR方法对8种涉及四环二萜类生物合成的转录本在王枣子不同组织中的表达谱进行了验证,解构该通路的基因表达谱。ISPD、ISPF和ISPH(MEP途径)以及IaCPS和IaKSL(二萜类途径)候选基因在叶片和根中的差异表达,可能是造成王枣子叶片中王枣子素积累较高的原因之一。本文报道的基因组数据和分析为进一步研究这一重要药用植物奠定了基础。材料与方法植物材料:一年生健康王枣子个体的根、茎、叶(3个重复)王枣子素的提取与鉴定(靶标代谢):种类:王枣子甲素、王枣子乙素和王枣子丙素        &...
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    招聘职位:

    销售工程师

    工作地点: 全国
    招聘人数: 15
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:

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    岗位要求:

    职位要求:

    1) 分子生物学、医学和农学相关专业,遗传育种专业优先,本科及以上学历;

    2) 学习过遗传学、分子生物学等相关课程,有分子生物学实验背景;

    3) 具有较强的理解能力及逻辑思维能力;

    4) 执行力强,团队协作意识好,善于沟通交流,亲和力强;

    5) 能承受较大工作压力;

    6) 有生物技术服务工作经验者优先。

    职位描述:

    1) 潜在客户挖掘,客户关系维护;

    2) 意向项目挖掘,根据客户需求提供个性化设计方案,项目签订;

    3) 项目跟进,促进项目顺利进行,保证项目回款;

    4) 积极了解并反馈客户需求;

    5) 积极了解并反馈产品竞争情况;

    6) 协助区域经理和产品经理进行区域产品推广活动。

    经验要求:
  • 2
    招聘职位:

    销售区域经理

    工作地点: 全国
    招聘人数: 8
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:
    岗位要求:

    职位要求:(具备销售工程师的经历外)

    (1) 情商高,能真诚、友善的与周边的人相处;

    (2) 具有组织、领导能力;

    (3)2年以上相关工作经验,签单能力强的本科也可以考虑

    职位描述:

    (1) 协助销售工程师挖掘潜在客户,维护客户关系;

    (2) 协助销售设计方案,项目签订;

    (3) 指导销售如何做好销售工作;

    (4) 统计区域内销售挖掘的意向,签单项目,回款等;

    (5) 制定区域内销售推广策略。

    经验要求:
  • 3
    招聘职位:

    生物信息工程师

    工作地点: 南京
    招聘人数: 10
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:
    岗位要求:

    职位要求:

    (1)遗传学、分子生物学等相关专业,本科或以上学历。

    (2)熟悉生物信息数据库网站,如UCSC,NCBI, EBI, Ensembl等;

    (3)英语优秀者优先;

    (4)工作主动性和责任心强,耐心仔细,积极好学,有强烈的事业心和团队合作精神。

    职位描述:

    (1)对高通量测序的SNP\CNV\RNA数据进行分析。配合制定合理的项目计划,承担信息分析工作;

    (2)把握项目的关键科学点,利用各种资源,解决项目中的技术问题;

    (3)进行数据挖掘分析,制作报告,对实验设计方案提供参考意见;

    (4)设计构建安全有效的数据库系统等工作。

    经验要求:
  • 4
    招聘职位:

    产品专员

    工作地点: 南京
    招聘人数: 5
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:
    岗位要求:

    职位要求:

    (1)生物学相关专业均可应聘。以基因组学、遗传学、分子进化、分子生物学、分子育种专业优先。硕士或博士学历;

    (2)一年以上分子实验室工作经验,具有基本分子实验操作能力,熟悉高通量测序者优先;

    (3) 有较强的英文文献阅读能力、理解能力及逻辑思维能力;

    (4) 团队协作意识好,善于沟通交流,亲和力强;能承受较大压力,愿意出差;

    (5) 有相关工作经验者优先。

    职位描述:

    (1) 通过产品包装推广等方式完成产品的销售任务;

    (2) 对销售工程师进行产品相关的系统培训;

    (3) 负责产品的包装和推广,提高产品的竞争力和市场影响力;

    (4) 负责针对具体项目出具项目方案并与销售共同完成项目谈判;

    (5)负责产品市场调研计划的制定及实施;建立健全的产品营销信息系统,负责内部信息、市场情报收集、整理、分析、交流及保密;

    (6) 协助销售部制定该产品的年度、季度市场营销策略、计划及预算,根据实际情况做出调整。

    经验要求:
  • 5
    招聘职位:

    实验技术员

    工作地点: 南京
    招聘人数: 10
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:
    岗位要求:

    职位要求:

    (1)生物学相关专业本科及以上学历;

    (2)一年以上分子实验室工作经验,具有基本分子实验操作能力,熟悉高通量测序者优先;

    (3)英语4级以上,具备一定英语文献阅读能力;

    (4)工作热情,责任感强,具体较好沟通和团队协助能力;

    职位描述:

    (1)DNA、RNA样品提取及检测,高通量测序文库构建;

    (2)严格按照任务单进行分子实验操作,在规定时间内高质量完成既定工作;

    (3)负责项目执行过程中各类记录及报告填写。

    经验要求:
  • 6
    招聘职位:

    医学科研及检测研发工程师

    工作地点: 南京
    招聘人数: 1
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:
    岗位要求:

    职位要求:

    (1)医学检验、基础医学、分子生物学等专业硕士以上学位;

    (2)熟悉人类基因组相关的主要数据库;

    (3)具有较强的理解能力及逻辑思维能力;

    (4)执行力强,团队协作意识好,善于沟通交流,亲和力强;

    (5)能承受压力。

    职位描述:

    (1)外显子测序、目标捕获测序,基因检测等的试验设计、信息分析、包装、推广;

    (2)在生产环节,负责检测报告按时保质地发出,并提供报告解读;

    (3)为销售部提供培训、技术支持和咨询。

    经验要求:
  • 7
    招聘职位:

    蛋白组学研发经理

    工作地点: 南京
    招聘人数: 2
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:
    岗位要求:

    职位要求:

    (1)分子生物学相关专业硕士及以上学历;

    (2)一年以上蛋白组学研究经验,熟悉质谱,色谱操作;

    (3)在蛋白组学方面有较深入的了解,能独立包装相关产品;

    (4)工作热情,责任感强,具体较好沟通和团队协助能力;

    职位描述:

    (1)包装蛋白组学相关产品的方案;

    (2)负责蛋白组学实验操作;

    (3)为销售部提供培训、技术支持和咨询。

    经验要求:
  • 8
    招聘职位:

    实验研发经理

    工作地点: 南京
    招聘人数: 5
    查看更多 2017 - 01 - 23
    年龄段; 0
    学历:
    岗位要求:

    职位要求:

    (1)具有医学、分子生物学等相关背景,硕士以上学历;

    (2)分子生物学实验室工作经验3年以上,实验室管理或者项目研发工作经验1年以上;

    (3)熟悉高通量测序实验室的相关操作流程,有扎实的建库、测序知识基础,有靶向富集或目标区域捕获相关经验,有多重PCR酶试剂研发经验者优先;    

    (4)具有创新精神,出色的解决问题能力;

    (5)熟练掌握相关实验技能,了解实验室相关法律法规以及质量管理规范。

    职位描述:

    (1)跟踪高通量基因检测领域的新技术新方法;

    (2)组织协调高通量基因检测方法和流程开发,制定相关技术的实验室SOP;

    (3)完成公司试验研发目标;

    (4)处理、协调和解决试验研发项目中出现的技术问题;

    (5)领导和管理整个高通量测序实验室的人员、技术等相关工作 

    经验要求:
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