K
叶绿体
eDNA
生信云
邻近标记
1
34
3
23
1

CUT&Tag-seq

发布日期:2025-08-28 浏览次数:616


分析内容:

 

 

样品要求: 

新鲜细胞:≥1*10^5

冻存细胞:≥5*10^5

动物组织:≥0.1g

植物组织:≥1g

真菌:≥0.3g

以上样本,最好能提供新鲜样本。无法满足的需液氮速冻,干冰寄送。

需提供ChIP级别的一抗,提供未稀释的一抗原液及说明书,以方便后续项目进行。

 

1. CUT&TagATAC-seqRNA-seq联合解析小麦再生的转录调控网络

研究团队使用RNA-seqATAC-seqCUT&Tag等多组学联合分析的方法,构建出小麦再生过程中的转录调控网络和表观遗传动态,发现了两个能显著提高小麦遗传转化效率的新基因。鉴定出转录因子TaDOF5.6TaDOF3.4作为提高不同小麦品种转化效率的新靶点,为小麦遗传改良提供了理论基础和实用工具。

小麦再生过程中,基因表达动态与染色质开放性和组蛋白修饰关联

构建小麦再生的转录调控网络

2. RNA聚合酶I是小鼠早期胚胎发育中驱动3D基因组形成所必需的,但人类不是

该研究聚焦于RNA聚合酶IPol I)在小鼠和人类早期胚胎发育中对3D基因组形成的作用,通过跨物种比较揭示了染色质结构调控的物种特异性差异。通过整合RNA-seqCUT&Tag的数据,分析Pol I的结合区域是否与染色质结构特征(如TAD边界、高频相互作用区域)存在关联,进而阐明Pol I3D基因组结构(如TAD形成与维持)的调控机制。

结合CUT&Tag技术分析Pol I结合模式

参考文献:

1. Uncovering the transcriptional regulatory network involved in boosting wheat regeneration and transformation (Nature Plants, 2023, IF = 15.8)

2. RNA polymerase I is essential for driving the formation of 3D genome in early embryonic development in mouse, but not in human (Genome Medicine , 2025, IF =13.8)