服务热线:025-85381280 / 18551854236
技术支持

【集思慧远客户】质体基因组文章盘点

发布日期:2019-07-31 浏览次数:1067


集思慧远教您一个植物叶绿体如何冲击二区期刊


       集思慧远于2018年开展植物质体基因组研究的服务,并于当年协助老师完成了麻栎叶绿体基因组文章的发表(International Journal of Molecular Sciences)。一年前的欣喜和激动至今依然历历在目······

       然而当年的故事并未结束,当年我们帮助老师同时完成了两种栎树的测序和相关分析工作。按照近两年植物叶绿体基因组文章发表的速度,单测一个物种(尤其是不做高级分析)这种基本上只能发表4区的Mitochondrial DNA Part B()。但是事实告诉大家,叶绿体基因组的高级分析依然可以把文章水平从4区拉到2区。

       不兜圈子了,真相就是当年的另一种栎树(坝王栎)基因组发表在农林类经典期刊Forests上。

坝王栎完整叶绿体基因组及系统发育分析

合作单位:南京林业大学

       本文采用坝王栎新鲜叶片进行总DNA提取,采用重测序的建库测序方式获得5.74 GB clean data。最终组装出完整的坝王栎叶绿体基因组161,394bp,IR区总长为51,730bp,大单拷贝区(LSC)90,628bp,小单拷贝区(SSC)19,306bp。基因组包含134个基因(86个编码蛋白基因,40个tRNAs,8个rRNAs),通过对9个壳斗科植物叶绿体基因组结构进行比较分析发现单拷贝区多样性显著高于反向重复区,这有利于该科的物种关系鉴定。系统发育树结果表明太鲁阁栎和坝王栎亲缘关系最近。

       以上只是坝王栎叶绿体基因组文章部分分析内容,全文免费在线下载链接:https://www.mdpi.com/1999-4907/10/7/587。

       介绍一下Mitochondrial DNA Part B吧,(OS:虽然文章影响因子稍低,但是也是正经的SCI期刊)而且接收的叶绿体基因组远超其他所有期刊,原因是分析内容确实比较简单而且见刊速度超级快······下面就让我们一起盘点一下2019年集思慧远Mitochondrial DNA Part B文章群吧:

石灰花楸完整叶绿体基因组

合作单位:南京林业大学

绿萝完整叶绿体基因组

合作单位:福建农林大学

板栗完整叶绿体基因组

合作单位:中国科学院江苏省植物研究所

桂花完整叶绿体基因组

合作单位:南京林业大学

白刺属两个种的完整叶绿体基因组

合作单位:中国科学院西北高原生物研究所

美国红梣完整叶绿体基因组

合作单位:南京林业大学

翼萼蔓完整叶绿体基因组

合作单位:青海民族大学

宁波木犀完整叶绿体基因组

合作单位:黄山职业技术学院

云南松完整叶绿体基因组

合作单位:三江学院

       总结一下,单个物种叶绿体基因组文章发表SCI是完全没有问题的,问题是您的追求是几区的期刊,这就取决于分析的内容是标准的组装、注释加一个系统进化树,or完整的高级分析内容详细解析不同物种间叶绿体基因组间的关系。

       叶绿体基因组虽然相对比较保守,但是不同科属间还是存在很大差异,并且特殊种属也存在较高异质性,结构特殊或者长重复序列。目前没有能解决所有问题在线的组装和注释软件,集思慧远(genepioneer biotechnology)拥有大量不同科属物种基因组的经验,结合的了其他组装、注释策略的优点,自行研发了能完成组装、注释的软件cppioneer(已在申请专利)。

       叶绿体基因组对揭示物种起源、进化演变及其不同物种之间的亲缘关系等方面具有重要价值。对于想研究植物进化方面的老师不妨从叶绿体方面入手,选择多个,亦或同科不同属,同属不同种的物种进行进化分析。

       如果您对叶绿体有兴趣,如果您想开拓新的研究,如果您想寻求一家专业的叶绿体基因组分析公司进行合作,那就不要犹豫了,我们就是您最值得信赖的那个公司。