建议收藏|分子标记检测大汇总,SNP分型新玩法
发布日期:2022-08-10 浏览次数:9548
分子标记
分子标记(MolecularMarkers)是个体间遗传物质内核苷酸序列变异,能直接地反映DNA水平的遗传变异。
随着时代的发展,丰富的分子标记不断被发现,先后出现了以RFLP,SSR,SNP为代表的三代DNA分子标记。其中简单重复序列(SSR,也被称为微卫星)和单核苷酸多态性(SNPs)已成为用于研究生物群体中的遗传变异最常用的分子标记,被广泛应用于种质资源遗传多样性分析、目标性状基因的标记与定位、抗性育种、作物品种纯度鉴定及品质鉴定等方面。这里给大家浅介绍一下三代分子标记吧!
第一代分子标记的代表是RFLP ( Restriction ragment Length Polymor-phism),即限制性内切酶片段长度多态性,在对研究样品基因组信息不清楚的情况下,使用随机选择性酶切以后进行电泳,利用众多条带的多态性进行区分。但由于成本高,实验步骤多,周期长,标记稳定性较差,目前已基本被淘汰。
第二代分子标记微卫星标记,也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),一般由2-6个核苷酸组成,是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。它具有多态性高、稳定可靠等特点,因此是一种十分理想的分子标记,在遗传图谱构建、数量性状位点(QTL)定位、标记辅助选择、遗传检测等领域都有着重要的应用价值。
SSR/STR标记的优势
01SSR/STR标记的优势微卫星呈共显性遗传,故可鉴别杂合子和纯合子;检测单一的多等位基因位点;易于利用PCR技术分析;检测结果重复性好,稳定可靠;所需 DNA 量少。
集思慧远提供多种SSR/STR标记检测方法,
为您提供全面的微卫星分析服务:
01利用变性PAGE电泳结合银染检测法该方法为最常用的SSR检测方法,适合前期引物的批量筛选;
02利用ABI测序仪进行的毛细管电泳荧光检测法该方法高效快捷,适合后期大量样本的检测。
SSR/STR检测流程
SSR/STR检测流程客户提供组织样品以及位点信息(待测STR/SSR位点、序列或引物)即可哦!
第三代分子标记-SNP,即单核苷酸多态性,在所有生物的基因组中含量丰富,突变率较低,且获取的成本低,因此被广泛用于遗传多样性、系统发育分析和遗传和疾病相关基因的研究中。
高通量SNP分型技术-KASP
集思慧远推出KASP(竞争性等位基因特异性PCR)技术,通过利用引物末端碱基的特异匹配来对SNPs和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判定,作为目前主流的SNP分型方法,其周期短,准确度高,已成为分子育种工作中的一项优选技术。
集思慧远有丰富的KASP检测经验,严格的质控标准及体系建立标准,可为客户提供:DNA提取+KASP标记开发+标记验证+标记检测整体解决方案!
结果展示
注:图中每个点代表一个样品;蓝色点表示该样品携带HEX标签序列(纯合);橙色点表示该样品携带FAM标签序列(纯合);绿色点表示该样品携带两种标签序列(杂合);黑色点为空白对照(NTC)
集思慧远提供多种SNP分型服务,分型方法包括:直接测序法、KASP基因分型方法、连接酶检测反应(LDR)分型方法、多重SNaPshot SNP分型方法,满足中、高通量的不同需求!
分子标记方法对种质资源进行基因分型后,可以借助一系列的数据分析软件对标记基因型进行分析。集思慧远精心推出具有针对性和实用性的“DNA指纹图谱+遗传多样性分析生信培训班”,从DNA分子标记技术出发,贯彻“研究思路→软件应用→数据分析实操→联合应用→图形美化”教学路线,贯穿该领域的研究进展、技术思路和分析流程,“线上教学+实操演练”呈现最丰富实用的课程体验,小班化教学,包教包会。
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