TBtools—教如何做带有进化树的环状热图
发布日期:2022-09-30 浏览次数:12194
首先我们需要准备两份数据
1
表达量数据,格式如下所示:
2
树(需为nwk)文件,格式如下:
好了,准备好上述两个文件,我们就可以开始可视化啦~~~~~
#1打开tbtools软件
#2我们的目的是热图的可视化,那我们就需要点击
Graphics—Heatmap IIIustrator—Heatmap。
#3上述操作完成后,我们就需要导入数据了。请往下看
表达量文件的数据可直接在1处进行粘贴或者直接点击2处导入表达量文件文件。树文件可再3(行名对应的树文件)或者4(列名对应的树文件)处直接进行粘贴。数据全部导入后点击start即可。
#4生成的热图见下:
#5默认的热图是不是有那么一丢丢的不尽如意,不用担心,那我们就调整一些参数,分分钟变成我们想要的热图。
接下来,我们就讲讲参数,见下方截图:
调整完,别忘记刷新哦。
往下看,调整完对的热图,是不是比默认的好了很多,但是……,还不是我们想要的话,软件作者不要太贴心,还设置了(Show Control Dialog)显示控制对话框
接下来,那我们就来研究研究这个控制对话框里面的参数了。点击后出现了更多的参数,其实根据英文意思调整就比较简单了,不过此处我们说一下,此次用到的一些参数,请看下图
哦,还有图例是可以移动的哦,可移动到自己想要的位置,保存图形即可。
保存图片的时候写文件的前缀就可以了
(但是别忘了,如果是路径,文件名称前记得加\)
完成后的图是不是很美观,过程是不是也很简单,那快来试试吧。
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